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Plusieurs activités humaines (ex. développement résidentiel et commercial, certains types d’agriculture) ou processus naturels (ex. prédation, broutage excessif) peuvent constituer des menaces pour la biodiversité. Ces menaces peuvent causer la détérioration d’une occurrence, d’une espèce, d’une communauté ou d’un écosystème. Le calcul de l’impact d’une menace, pour chaque occurrence, est basé sur l’interaction entre sa portée (superficie affectée) et sa sévérité pour l’espèce (déclin appréhendé de la population dans la zone touchée). Ce calcul permet d’obtenir une cote d’impact pour une menace allant de nul à très élevé. Chaque cote est associée à une valeur numérique :

La somme des cotes d’impact de toutes les menaces affectant une occurrence permet d’obtenir la cote d’impact cumulatif de cette occurrence. Les résultats de l’analyse des menaces sont présentés dans une grille cartographique. Pour chaque carré de grille, les cotes d’impact cumulatif de toutes les occurrences présentes sont additionnées. Cette somme des cotes d’impact cumulatif permet d’identifier les « points chauds » des menaces pour les occurrences.